Protein–RNA interactions for Protein: O75891

ALDH1L1, Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1L1O75891 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALDH1L1O75891 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALDH1L1O75891 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms