Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DENRO43583 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DENRO43583 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DENRO43583 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DENRO43583 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DENRO43583 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DENRO43583 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DENRO43583 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DENRO43583 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DENRO43583 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DENRO43583 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DENRO43583 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DENRO43583 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DENRO43583 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DENRO43583 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DENRO43583 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DENRO43583 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DENRO43583 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DENRO43583 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DENRO43583 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DENRO43583 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DENRO43583 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DENRO43583 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DENRO43583 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DENRO43583 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DENRO43583 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms