Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRTM2O43300 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRTM2O43300 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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