Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUPL2O15504 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUPL2O15504 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms