Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EBAG9O00559 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms