Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms