Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB7

TMEM221, Transmembrane protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM221A6NGB7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM221A6NGB7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM221A6NGB7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM221A6NGB7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms