Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB19A4D1S5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAB19A4D1S5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms