Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCE3A1L190 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCE3A1L190 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms