Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TGFBI-201ENST00000442011 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RAB40CQ96S21 LIF-201ENST00000249075 3969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 INTS14-203ENST00000431261 1980 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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RAB40CQ96S21 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 OPN1MW3-201ENST00000599405 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 AC016831.5-201ENST00000605249 1998 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PMEL-201ENST00000449260 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RAB40CQ96S21 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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