Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RUBCNL-208ENST00000429979 3979 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TMEM225BP0DP42 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.8 ms