Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PCDHGA7-202ENST00000617050 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CA13-201ENST00000321764 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PPP1R26P3-201ENST00000612861 3800 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SNX16-203ENST00000396330 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TNFSF13B-202ENST00000430559 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PARGP1-201ENST00000417555 2286 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ALDH7A1-224ENST00000636743 2332 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CADM1-212ENST00000542447 4223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NR2F1-AS1-213ENST00000607797 3380 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LAMA4-219ENST00000522006 6438 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 COL5A2-201ENST00000374866 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TGS1-201ENST00000260129 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FLT4-206ENST00000502649 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 NELL2-203ENST00000429094 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SCN5A-207ENST00000449557 5898 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 PIGO-203ENST00000378617 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SMIM3Q9BZL3 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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