Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TTC16-201ENST00000373289 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DCLRE1C-208ENST00000378258 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NICN1Q9BSH3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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