Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GY48 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GY48 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
V9GY48 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GY48 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GY48 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GY48 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GY48 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GY48 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GY48 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GY48 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GY48 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
V9GY48 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
V9GY48 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
V9GY48 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
V9GY48 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
V9GY48 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GY48 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GY48 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
V9GY48 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
V9GY48 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
V9GY48 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
V9GY48 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
V9GY48 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
V9GY48 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
V9GY48 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GY48 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GY48 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.7 ms