Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPN6Q9Y6Q1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN6Q9Y6Q1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN6Q9Y6Q1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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