Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAD1L1Q9Y6D9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms