Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX5Q9Y5X3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNX5Q9Y5X3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms