Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX10Q9Y5X0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms