Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAI2Q9Y5P3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAI2Q9Y5P3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms