Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANGPTL3Q9Y5C1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANGPTL3Q9Y5C1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANGPTL3Q9Y5C1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANGPTL3Q9Y5C1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANGPTL3Q9Y5C1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANGPTL3Q9Y5C1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANGPTL3Q9Y5C1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANGPTL3Q9Y5C1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANGPTL3Q9Y5C1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANGPTL3Q9Y5C1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANGPTL3Q9Y5C1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms