Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAXBP1Q9Y5B6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAXBP1Q9Y5B6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms