Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms