Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NUDCQ9Y266 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms