Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PNMA8BQ9ULN7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PNMA8BQ9ULN7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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