Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN16Q9UKR8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN16Q9UKR8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN16Q9UKR8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN16Q9UKR8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms