Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC23Q9UJX2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC23Q9UJX2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms