Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPSF2Q9P2I0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPSF2Q9P2I0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPSF2Q9P2I0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms