Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GCNT4Q9P109 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNT4Q9P109 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms