Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KCMF1Q9P0J7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCMF1Q9P0J7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms