Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NCKIPSDQ9NZQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCKIPSDQ9NZQ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms