Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COMMD8Q9NX08 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COMMD8Q9NX08 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
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