Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DMRT3Q9NQL9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DMRT3Q9NQL9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms