Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPF1Q9H9Y2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF1Q9H9Y2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms