Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM60Q9H2L4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms