Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC39A8Q9C0K1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC39A8Q9C0K1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms