Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM4Q9C037 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM4Q9C037 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM4Q9C037 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms