Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
THUMPD2Q9BTF0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
THUMPD2Q9BTF0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
THUMPD2Q9BTF0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms