Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NIPSNAP3BQ9BS92 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms