Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SIKE1Q9BRV8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIKE1Q9BRV8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms