Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF559Q9BR84 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF559Q9BR84 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms