Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMIM7Q9BQ49 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms