Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX50Q9BQ39 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX50Q9BQ39 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms