Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SIN3AQ96ST3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SIN3AQ96ST3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SIN3AQ96ST3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms