Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HHIPQ96QV1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HHIPQ96QV1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms