Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOPNLQ96NB1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOPNLQ96NB1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms