Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC43Q96MW1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC43Q96MW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms