Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSL1Q96IY1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSL1Q96IY1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms