Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUCLG2Q96I99 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SUCLG2Q96I99 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUCLG2Q96I99 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms