Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms