Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIGD2Q96BF3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms